Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm5849J3QPE5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5849J3QPE5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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