Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm5294J3QP53 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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