Protein–RNA interactions for Protein: J3QNV7

Gm10428, Predicted gene 10428, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10428J3QNV7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm10428J3QNV7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm10428J3QNV7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm10428J3QNV7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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