Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim18J3QNP2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smim18J3QNP2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Smim18J3QNP2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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