Protein–RNA interactions for Protein: J3QN05

Gm21834, Predicted gene, 21834, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21834J3QN05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm21834J3QN05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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