Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Gm6594J3QM43 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm6594J3QM43 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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