Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
7530416G11RikJ3QJX6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms