Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm21818J3KMS6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm21818J3KMS6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm21818J3KMS6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm21818J3KMS6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21818J3KMS6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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