Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm21411J3KMS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms