Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r34G3XA52 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r34G3XA52 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms