Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf148G3X9R7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf148G3X9R7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms