Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hmgxb3G3X9M3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms