Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nccrp1G3X9C2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nccrp1G3X9C2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms