Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim15G3UY57 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim15G3UY57 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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