Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp9yF8VPU6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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