Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Arid4aF8VPQ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Arid4aF8VPQ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms