Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm3443F7CCV5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm3443F7CCV5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm3443F7CCV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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