Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8005F6YKY3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8005F6YKY3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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