Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Igkv1-99F6XWB2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Igkv1-99F6XWB2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms