Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zfp946F6VWU8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp946F6VWU8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms