Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8247F6VRJ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm8247F6VRJ8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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