Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5861F6VCN9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm5861F6VCN9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms