Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5407E9Q7Q1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm5407E9Q7Q1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms