Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PtproE9Q612 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtproE9Q612 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms