Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
4930579F01RikE9Q3L6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms