Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap11-1E9Q2E9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap11-1E9Q2E9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms