Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc171E9Q1U1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc171E9Q1U1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms