Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zfp558E9Q1J0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Zfp558E9Q1J0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Zfp558E9Q1J0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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