Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms