Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r177E9PXM3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms