Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Rsf1E9PWW9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rsf1E9PWW9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rsf1E9PWW9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rsf1E9PWW9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rsf1E9PWW9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms