Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MccE9PWI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MccE9PWI3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms