Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syde2E9PUP1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Syde2E9PUP1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms