Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Vpreb3D3Z6J4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms