Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms