Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms