Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc8D3YZV8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc8D3YZV8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms