Protein–RNA interactions for Protein: D3YZU1

Shank1, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank1D3YZU1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shank1D3YZU1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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