Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc6D3YZP9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc6D3YZP9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms