Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmf1B9EKI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tmf1B9EKI3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmf1B9EKI3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms