Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdzd8B9EJ80 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdzd8B9EJ80 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms