Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Clip3B9EHT4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clip3B9EHT4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms