Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Apol6B7ZC55 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Apol6B7ZC55 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms