Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6133B2RY53 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6133B2RY53 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms