Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Siah3B2RWG3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Siah3B2RWG3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms