Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Zscan5bB2RTN3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zscan5bB2RTN3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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