Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
1700011M02RikB1AX35 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms