Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms