Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atp8b5A3FIN4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atp8b5A3FIN4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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