Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GabreA2AMW3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GabreA2AMW3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms